Здравствуйте!

"наличие в паспорте туриста отметок портов турецкой части, острова может послужить отказом в выдаче кипрской визы  или в Грецию в будущем" - означает, что по Кипрской визе не желательно въезжать на Кипр через порты Турции.  

То, что Вы были в Турции, отдыхали там, не имеет к этому никакого отношения.